{"status":"OK","data":{"advertisement":{"id":291745,"title":"Us\u0142uga wykonania analiz zestaw\u00f3w danych genomowych oraz fenotypowych przy pomocy wielkoskalowych metod statystycznych i algorytm\u00f3w sztucznej inteligencji dla potrzeb Instytutu Farmakologii im. Jerzego Maja Polskiej Akademii Nauk w Krakowie przy realizacji projektu pn: \"Wielogenowe predyktory skuteczno\u015bci farmakoterapii dostosowane do wieku pacjenta\" nr KPOD.07.07-IW.07-0099/24 w ramach Krajowego Planu Odbudowy i Zwi\u0119kszania Odporno\u015bci.","partial_offer_allowed":false,"publication_date":"2025-03-24","submission_deadline":"2025-04-01 10:00:00","planned_sign_date":"2025-04-01","supplementary_orders":null,"terms_of_contract_change":null,"created_at":"2025-03-24 12:06:14","modified_at":"2025-04-01 10:00:08","contact_persons":[{"id":21541,"forename":"Artur","surname":"Rzepecki","phone_number":"12 662 32 97","email":"dzp@if-pan.krakow.pl","created_by":null,"created_at":"2022-10-27 09:57:47","modified_at":"2022-10-27 09:57:47","modified_by":null}],"orders":[{"id":473698,"estimated_value":null,"order_items":[{"id":534532,"description":"Zamawiaj\u0105cy zleca wykonanie analizy zestaw\u00f3w danych genomowych oraz fenotypowych przy pomocy wielkoskalowych metod statystycznych i algorytm\u00f3w sztucznej inteligencji. Szczeg\u00f3\u0142owo zadanie dotyczy przeprowadzenia bada\u0144 asocjacyjnych oraz utworzenia i walidacji modeli predykcyjnych przewiduj\u0105cych indywidualne profile odpowiedzi lekowej. Dane wej\u015bciowe zostan\u0105 przygotowane przez Zamawiaj\u0105cego w ramach przedmiotowego projektu. Planowane jest wykorzystanie takich metod uczenia maszynowego jak REGENIE, LDAK-KVIK, XGBoost, CI-GWAS oraz metod agregacji wariant\u00f3w genetycznych jak LOFTEE czy missense deleteriousness metric (MPC). Zam\u00f3wienie obejmuje przygotowanie danych oraz wykonanie analiz ok. 2.5M wariant\u00f3w genetycznych (odczyty ok. 500 000 genom\u00f3w) oraz danych fenotypowych (pomi\u0119dzy 500 a 2000 parametr\u00f3w dla 230 000 os\u00f3b zgromadzonych w bazie UKB). \n\nZam\u00f3wienie obejmuje wykonanie oceny skuteczno\u015bci i por\u00f3wnania r\u00f3\u017cnych modeli predykcyjnych na zestawie danych testowych. W ramach zam\u00f3wienia wykonane zostanie trenowanie i testowanie modeli obliczeniowych na danych ucz\u0105cych w \u015brodowisku chmurowym platformy RAP obs\u0142uguj\u0105cej bank genom\u00f3w UKB. W ramach zam\u00f3wienia nale\u017cy zaimplementowa\u0107 i rozwin\u0105\u0107 zestaw metod i narz\u0119dzi bioinformatycznych, w tym wykorzystuj\u0105cych uczenie maszynowe. Wyniki analizy powinny zosta\u0107 przedstawione w postaci zestaw\u00f3w tabelarycznych oraz raport\u00f3w opisuj\u0105cych efekty prac wraz z wizualizacjami, kt\u00f3re b\u0119d\u0105 wykorzystywane w publikacjach naukowych. Realizacja prac i zastosowana metodyka musi by\u0107 adekwatnie udokumentowana i opisana w \u015brodowisku GitHub przy u\u017cyciu j\u0119zyka angielskiego. Wykonawca b\u0119dzie zobowi\u0105zany ka\u017cdorazowo do przeprowadzenia analiz w terminie 30 dni od dnia przekazania mu zestawu danych przez Zamawiaj\u0105cego.\n\nUmowa b\u0119dzie obowi\u0105zywa\u0107 od dnia podpisania do dnia 31.03.2026 r.\nPrzedmiot zam\u00f3wienia dotyczy projektu pn: \"Wielogenowe predyktory skuteczno\u015bci farmakoterapii dostosowane do wieku pacjenta\" nr KPOD.07.07-IW.07-0099/24 w ramach Krajowego Planu Odbudowy i Zwi\u0119kszania Odporno\u015bci, Komponent D Efektywno\u015b\u0107, dost\u0119pno\u015b\u0107 i jako\u015b\u0107 systemu ochrony zdrowia, Inwestycja D3.1.1 Kompleksowy rozw\u00f3j bada\u0144 w zakresie nauk medycznych i nauk o zdrowiu, Konkurs nr 2024/ABM/03/KPO dla jednostek naukowych na realizacj\u0119 bada\u0144 o charakterze aplikacyjnym w obszarze biomedycznym, kt\u00f3ry jest realizowany przez Zamawiaj\u0105cego.\n \nOsoby zdolne do wykonania zam\u00f3wienia\n\nOpis\n\nO udzielenie zam\u00f3wienia mog\u0105 ubiega\u0107 si\u0119 Oferenci, kt\u00f3rzy posiadaj\u0105 wiedz\u0119 i multidyscyplinarne do\u015bwiadczenie z zakresu stosowania algorytm\u00f3w do analizy du\u017cych zbior\u00f3w danych, uczenia maszynowego, wielkoskalowej genetyki cz\u0142owieka oraz farmakogenomiki potwierdzone wsp\u00f3\u0142autorstwem w co najmniej 5 publikacjach naukowych w czasopismach o zasi\u0119gu mi\u0119dzynarodowym. Do realizacji zam\u00f3wienia wymagane jest wy\u017csze wykszta\u0142cenie matematyczne lub informatyczne oraz znajomo\u015b\u0107 j\u0119zyka angielskiego. Zdolno\u015b\u0107 do prowadzenia analiz danych na platformie RAP musi by\u0107 potwierdzona stosownymi certyfikatami dost\u0119powymi.\nSzczeg\u00f3\u0142owo opisane w Zaproszeniu do sk\u0142adania ofert.\n","warranty_period":null,"cpv_items":[{"id":8515,"code":"73111000-3","name":"Laboratoryjne us\u0142ugi badawcze"}],"timetable_items":[],"fulfillment_places":[{"country":"Polska","voivodeship":"ma\u0142opolskie","poviat":"Krak\u00f3w","commune":"Krak\u00f3w-Krowodrza","locality":"Krak\u00f3w","created_by":null,"created_at":"2025-03-24 12:06:14","modified_at":"2025-03-24 13:27:23","modified_by":null,"id":603265,"type":{"id":1,"name":"adres"},"group_uuid":"4ecf80ba-6beb-4497-b66d-4770fbd0958d"}],"participation_conditions":[],"category":{"id":1,"name":"Us\u0142uga"},"subcategory":{"id":4,"name":"Us\u0142ugi badawcze"},"created_by":null,"created_at":"2025-03-24 12:06:14","modified_at":"2025-03-24 13:27:23","modified_by":null,"group_uuid":"6f5b6d16-7a7d-489f-9c5f-2a27e69d44f9"}],"evaluation_criteria":[{"id":833601,"price_criterion":true,"description":"Cena - 100 %","created_by":null,"created_at":"2025-03-24 12:21:53","modified_at":"2025-03-24 13:27:23","modified_by":null,"group_uuid":"0e7eb067-b6bc-48e9-9fa7-4ff5078bb514"}],"is_variant":false,"title":"Us\u0142uga wykonania analiz zestaw\u00f3w danych genomowych oraz ....","order_node":{"id":358828},"created_by":null,"created_at":"2025-03-24 12:06:14","modified_at":"2025-03-24 13:27:23","modified_by":null}],"created_by":{"id":22482,"contact_persons":[]},"modified_by":{"modified_by":null,"id":1,"contact_persons":[]},"status":{"id":2,"label":"PUBLISHED","name":"Opublikowane"},"advertiser_address_details":{"name":"Instytut Farmakologii im. Jerzego Maja Polskiej Akademii Nauk","identification_number_type":"nip","identification_number":"6750001828","address":{"country":"Polska","voivodeship":"ma\u0142opolskie","poviat":"Krak\u00f3w","commune":"Krak\u00f3w-Krowodrza","locality":"Krak\u00f3w","created_by":null,"created_at":null,"modified_at":null,"modified_by":null,"id":807146,"street":"Sm\u0119tna","number_description":"12","postcode":"31-343"},"created_by":{"id":22482,"contact_persons":[]},"created_at":"2025-03-24 12:06:13","modified_at":"2025-03-24 12:06:13","modified_by":{"id":22482,"contact_persons":[]},"id":292524},"advertisement":{"id":221440,"number":"2025-22482-221440","publication_date":"2025-03-24","created_by":{"id":22482,"contact_persons":[]},"created_at":"2025-03-24 12:06:13","modified_at":"2025-04-01 10:00:08","modified_by":{"modified_by":null,"id":1,"contact_persons":[]},"status":{"id":6,"label":"RESOLVED","name":"Rozstrzygni\u0119te"},"all_available_version_ids":[291745],"enrollment":null,"projects":[{"id":58001,"name":"Wielogenowe predyktory skuteczno\u015bci farmakoterapii dostosowane do wieku pacjenta","number":"0099/24","activity":{"created_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]},"created_at":"2025-02-21 07:12:20","modified_at":"2025-02-21 07:12:20","modified_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]}},"region":null,"institution":{"created_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]},"created_at":"2025-02-21 08:20:32","modified_at":"2025-02-21 08:20:32","modified_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]}},"full_number":"KPOD.07.07-IW.07-0099/24","perspective":{},"programme":{"created_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]},"created_at":"2023-05-25 08:16:12","modified_at":"2023-05-25 08:16:12","modified_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]}},"priority":{"created_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]},"created_at":"2025-02-20 10:10:06","modified_at":"2025-02-20 10:10:06","modified_by":{"id":114,"contact_persons":[{"id":43,"forename":"Anna","surname":"Nowak","phone_number":"111222333","email":"anna@email.com","created_at":"2026-08-26 10:58:57","modified_at":"2026-08-26 10:58:57"}]}},"type":"project","created_by":{"id":22482,"contact_persons":[]},"created_at":"2025-03-24 12:16:02","modified_at":"2025-03-24 12:16:02","modified_by":{"id":22482,"contact_persons":[]}}],"is_author":false,"is_admin":false},"attachments":[{"origin":{"id":291745,"publication_date":"2025-03-24"},"id":1731274,"name":"Zaproszenie do sk\u0142adania ofert","file":{"id":1928152,"name":"Zaproszenie do sk\u0142adania ofert.pdf","created_at":"2025-03-24 13:26:39","created_by":{"forename":"Artur","surname":"Rzepecki"},"uri":"/api/files/1928152"},"group_uuid":"042d40d3-62a2-4595-8432-45a0fd796950"},{"origin":{"id":291745,"publication_date":"2025-03-24"},"id":1731275,"name":"Za\u0142. 1 - Formularz ofertowy IF-ZNP-06-2025","file":{"id":1928156,"name":"Za\u0142. 1 - Formularz ofertowy IF-ZNP-06-2025.docx","created_at":"2025-03-24 13:27:01","created_by":{"forename":"Artur","surname":"Rzepecki"},"uri":"/api/files/1928156"},"group_uuid":"217feffc-7784-451f-b0a3-fe2614c5dc24"}]},"dictionaries":{"announcement_status_draft":1,"announcement_status_published":2},"favorite":null,"badge":null,"offer_set_badge_count":null,"question_badge_count":null}}