{"status":"OK","data":{"advertisement":{"id":268559,"title":"ZAPYTANIE OFERTOWE nr VCT/CKD/5/2024 - Us\u0142uga wykonania analizy bioinformatycznej danych przekazanych przez Zamawiaj\u0105cego","partial_offer_allowed":false,"publication_date":"2024-11-08","submission_deadline":"2024-11-18 23:59:59","planned_sign_date":null,"supplementary_orders":null,"terms_of_contract_change":"zgodnie z zapytaniem ofertowym","created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-19 00:00:06","contact_persons":[{"id":61324,"forename":"Konrad","surname":"Szczukiewicz","phone_number":"+48514448784","email":"konrad@vetcelltech.com","created_by":null,"created_at":"2026-09-07 19:13:31","modified_at":"2026-09-07 19:13:31","modified_by":null}],"orders":[{"id":434916,"estimated_value":null,"order_items":[{"id":490352,"description":"\nWybrany Wykonawca odpowiedzialny b\u0119dzie za wykonanie us\u0142ugi polegaj\u0105cej na analizie bioinformatycznej danych przekazanych przez Zamawiaj\u0105cego.\n\nUs\u0142uga zewn\u0119trzna obejmuje analizy danych otrzymanych za pomoc\u0105 metody sekwencjonowania nast\u0119pnej generacji NGS oraz sekwencjonowania bia\u0142ek. \nAnaliza bioinformatyczna wynik\u00f3w NGS obejmuje mapowanie i normalizacj\u0119 transkrypt\u00f3w wyodr\u0119bnienie transkrypt\u00f3w koduj\u0105cych, niekoduj\u0105cych i pseudogen\u00f3w. \nAnalizy sekwencji bia\u0142ek powinny uwzgl\u0119dnia\u0107 m.in.: filtracj\u0119 danych, testowanie warto\u015bci odstaj\u0105cych, sporz\u0105dzanie wykres\u00f3w wariancji za pomoc\u0105 PCA, grupowanie, statystyk\u0119 oraz interpretacj\u0119 wynik\u00f3w\n\nWykonanie analizy bioinformatyczno-statystycznej dostarczonych przez Zamawiaj\u0105cego danych obejmuje r\u00f3wnie\u017c:\n- konsultacje merytoryczne w zakresie przygotowanego planu analiz z uwzgl\u0119dnieniem planowanych narz\u0119dzi badawczych i przyj\u0119tych konstrukt\u00f3w teoretycznych (\u0142\u0105cznie 1 godzina w trybie zdalnym);\n- przygotowanie surowych danych przeznaczonych do analizy;\n- bie\u017c\u0105ce konsultacje dotycz\u0105ce oceny, interpretacji i generalizacji przekazanych wynik\u00f3w oraz wykonywanych analiz (\u0142\u0105cznie 1 godzina w trybie zdalnym).\n- wykonanie analiz kierunkowych z zastosowaniem modeli analizy wielowymiarowych oraz innych metod koniecznych do przeprowadzenia analiz wspomnianych danych przy za\u0142o\u017ceniu okre\u015blonych tez.\n\nWykonawca po zako\u0144czeniu prac przeka\u017ce Zamawiaj\u0105cemu raport wraz z danymi do analiz bioinformatycznych obejmuj\u0105cy:\n- mapowanie odczyt\u00f3w do genomu referencyjnego\n- podliczenie ilo\u015bci odczyt\u00f3w zmapowanych do poszczeg\u00f3lnych gen\u00f3w\n- przypisanie adnotacji dla gen\u00f3w\n- analiza r\u00f3\u017cnicowa ekspresji w obr\u0119bie por\u00f3wna\u0144 (DEGs)\n- interpretacja funkcjonaln\u0105 opart\u0105 na ontologii gen\u00f3w (GO) i szlakach KEGG\n- analiza GSEA (Gene Set Enrichment Analysis) - identyfikacja istotnych szlak\u00f3w biologicznych lub funkcji gen\u00f3w na podstawie wzorca ich ekspresji\n\nPrzedstawienie wynik\u00f3w powy\u017cszych analiz nast\u0105pi w postaci raport\u00f3w/zestawie\u0144 zawieraj\u0105cych szczeg\u00f3\u0142owe wyja\u015bnienie zastosowanych analiz z uzasadnieniem doboru test\u00f3w statystycznych oraz graficzne przedstawienie wynik\u00f3w w formie, kt\u00f3ra ma stanowi\u0107 baz\u0119 m.in. do przygotowania opracowa\u0144 naukowych (publikacji).\n\nWykonawca po zako\u0144czeniu prac przeka\u017ce Zamawiaj\u0105cemu szczeg\u00f3\u0142owego opisu metodyki wszystkich wykonanych analiz.\n\nLiczba pr\u00f3bek do analizy: 18 (analizy danych proteomu - 9 pr\u00f3bek, analizy danych transkryptomu - 9 pr\u00f3bek).\n\nMiejsce realizacji zam\u00f3wienia: wskazane przez Wykonawc\u0119.\n\nDodatkowe informacje:\n\n1. Zamawiaj\u0105cy zastrzega sobie prawo do zmiany lub uzupe\u0142nienia tre\u015bci niniejszego zapytania ofertowego. Je\u017celi zmiany b\u0119d\u0105 mog\u0142y mie\u0107 istotny wp\u0142yw na sk\u0142adane w post\u0119powaniu oferty, Zamawiaj\u0105cy przed\u0142u\u017cy termin sk\u0142adania ofert. Informacja  o zmianach zostanie umieszczona tak jak og\u0142oszenie, na stronie Bazy Konkurencyjno\u015bci: https://bazakonkurencyjnosci.funduszeeuropejskie.gov.pl\n\n2. Zamawiaj\u0105cy zastrzega sobie prawo do uniewa\u017cnienia niniejszego zapytania ofertowego bez podania uzasadnienia oraz do pozostawienia post\u0119powania bez wyboru oferty.\n\n3. W razie pyta\u0144 do przedmiotu zam\u00f3wienia b\u0105d\u017a sposobu przygotowania oferty, nale\u017cy je sk\u0142ada\u0107 pisemnie na stronie Bazy Konkurencyjno\u015bci poprzez zak\u0142adk\u0119 Pytania: https://bazakonkurencyjnosci.funduszeeuropejskie.gov.pl\n\n","warranty_period":null,"cpv_items":[{"id":8513,"code":"73100000-3","name":"Us\u0142ugi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe"}],"timetable_items":[],"fulfillment_places":[{"country":"Polska","voivodeship":null,"poviat":null,"commune":null,"locality":null,"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"id":551894,"type":{"id":2,"name":"ca\u0142a Polska"},"group_uuid":"13f0d0f0-3106-4087-8650-4481e53f1852"}],"participation_conditions":[{"id":1355559,"description":"Zamawiaj\u0105cy wymaga, aby w ramach oferty przed\u0142o\u017cone zosta\u0142y nast\u0119puj\u0105ce dokumenty: \n1. Formularz ofertowy zgodnie z Za\u0142\u0105cznikiem nr 1 do zapytania ofertowego,\n2. O\u015bwiadczenia wynikaj\u0105ce z pkt III zapytania ofertowego i zgodnie z Za\u0142\u0105cznikiem nr 1 do zapytania ofertowego,\n3. Pe\u0142nomocnictwo do wyst\u0119powania w imieniu Wykonawcy (je\u017celi dotyczy).","type":{"id":6,"name":"Lista wymaganych dokument\u00f3w/o\u015bwiadcze\u0144"},"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"78475f22-cf96-420f-b0bb-a67ace31f0bd"},{"id":1355560,"description":"Zamawiaj\u0105cy wymaga od Wykonawcy dysponowania odpowiednim potencja\u0142em kadrowym - min. 1 osoba posiadaj\u0105ca co najmniej roczne do\u015bwiadczenie w prowadzeniu analiz bioinformatycznych transkryptomu/proteomu.\nWeryfikacja nast\u0105pi w oparciu o o\u015bwiadczenie Wykonawcy o posiadaniu potencja\u0142u kadrowego niezb\u0119dnego do realizacji przedmiotu zam\u00f3wienia, zawarte w Za\u0142\u0105czniku nr 1 \u201cFormularz ofertowy\u201d.","type":{"id":2,"name":"Wiedza i do\u015bwiadczenie"},"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"6fed395a-339a-4eb9-90f7-86cb3781901f"},{"id":1355561,"description":"Zamawiaj\u0105cy wymaga od Wykonawcy posiadania statusu organizacji badawczej (w rozumieniu Zasad ramowych pomocy pa\u0144stwa na dzia\u0142alno\u015b\u0107 badawcz\u0105, rozwojow\u0105 i innowacyjn\u0105, pkt 16 ppkt ff)) lub przedsi\u0119biorcy posiadaj\u0105cego status centrum badawczo-rozwojowego, na podstawie ustawy z dn. 30 maja 2008 r. o niekt\u00f3rych formach wspierania dzia\u0142alno\u015bci innowacyjnej, nadany przez Ministra w\u0142a\u015bciwego ds. gospodarki.\n\nWeryfikacja nast\u0105pi w oparciu o o\u015bwiadczenie Wykonawcy o posiadaniu statusu organizacji badawczej lub statusu centrum badawczo-rozwojowego, zawarte w Za\u0142\u0105czniku nr 1 \u201cFormularz ofertowy\u201d.","type":{"id":7,"name":"Dodatkowe warunki udzia\u0142u"},"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"6bd50ae3-5bc1-413c-bb16-b8f12bb78dfc"},{"id":1357469,"description":"Zamawiaj\u0105cy wymaga od Wykonawcy posiadania sytuacji ekonomicznej lub finansowej zapewniaj\u0105cej prawid\u0142ow\u0105 realizacj\u0119 zam\u00f3wienia, w szczeg\u00f3lno\u015bci nie znajduje si\u0119 w stanie upad\u0142o\u015bci, restrukturyzacji lub likwidacji.\n\nWeryfikacja nast\u0105pi w oparciu o o\u015bwiadczenie Wykonawcy, \u017ce znajduje si\u0119 w sytuacji ekonomicznej lub finansowej zapewniaj\u0105cej prawid\u0142ow\u0105 realizacj\u0119 zam\u00f3wienia,                              w szczeg\u00f3lno\u015bci nie znajduje si\u0119 w stanie upad\u0142o\u015bci, restrukturyzacji lub likwidacji, zawarte                  w Za\u0142\u0105czniku nr 1 \u201cFormularz ofertowy\u201d.","type":{"id":5,"name":"Sytuacja ekonomiczna i finansowa"},"created_by":null,"created_at":"2024-11-05 13:42:17","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"ef9a2fc5-44cf-44af-9d63-85850ba99554"}],"category":{"id":1,"name":"Us\u0142uga"},"subcategory":{"id":8,"name":"Us\u0142ugi inne"},"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"633459a7-bdea-4e25-ac4f-2173ba173442"}],"evaluation_criteria":[{"id":755381,"price_criterion":true,"description":"Cena netto -100%","created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null,"group_uuid":"06fbd600-266f-4d9f-a5bd-829c9f94e514"}],"is_variant":false,"title":"Us\u0142uga analizy bioinformatycznej przekazanych danych","order_node":{"id":329445},"created_by":null,"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-08 16:37:01","modified_by":null}],"created_by":{"id":61112,"contact_persons":[]},"modified_by":{"modified_by":null,"id":1,"contact_persons":[]},"status":{"id":2,"label":"PUBLISHED","name":"Opublikowane"},"advertiser_address_details":{"name":"VET CELL TECH sp\u00f3\u0142ka z ograniczon\u0105 odpowiedzialno\u015bci\u0105","identification_number_type":"nip","identification_number":"6762639198","address":{"country":"Polska","voivodeship":"ma\u0142opolskie","poviat":"Krak\u00f3w","commune":"Krak\u00f3w-Podg\u00f3rze","locality":"Krak\u00f3w","created_by":null,"created_at":null,"modified_at":null,"modified_by":null,"id":730991,"street":"Profesora Micha\u0142a Bobrzy\u0144skiego","number_description":"14","postcode":"30-348"},"created_by":{"id":61112,"contact_persons":[]},"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_by":{"id":61112,"contact_persons":[]},"id":269178},"advertisement":{"id":203958,"number":"2024-61112-203958","publication_date":"2024-11-08","created_by":{"id":61112,"contact_persons":[]},"created_at":"2024-11-01 21:37:04","modified_at":"2024-11-19 00:00:06","modified_by":{"modified_by":null,"id":1,"contact_persons":[]},"status":{"id":6,"label":"RESOLVED","name":"Rozstrzygni\u0119te"},"all_available_version_ids":[268559],"enrollment":null,"projects":[{"id":51253,"name":"\u201eOpracowanie globalnie innowacyjnego leku weterynaryjnego na przewlek\u0142e zapalenie nerek u kot\u00f3w, opartego o allogeniczne kom\u00f3rki macierzyste oraz wdro\u017cenie produkcji w warunkach stand. farmaceut. GMP","number":"0299/23","activity":{"created_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]},"created_at":"2023-02-23 09:41:01","modified_at":"2023-02-23 09:41:01","modified_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]}},"region":null,"institution":{"created_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]},"created_at":"2023-02-23 10:43:43","modified_at":"2023-02-23 10:43:43","modified_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]}},"full_number":"FEMP.01.01-IP.01-0299/23","perspective":{},"programme":{"created_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]},"created_at":"2023-02-23 09:39:27","modified_at":"2023-02-23 09:39:27","modified_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]}},"priority":{"created_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]},"created_at":"2023-02-23 09:39:44","modified_at":"2023-02-23 09:39:44","modified_by":{"modified_by":null,"id":89,"contact_persons":[]}},"type":"project","created_by":{"id":61112,"contact_persons":[]},"created_at":"2024-10-15 15:09:35","modified_at":"2024-10-15 15:09:35","modified_by":{"id":61112,"contact_persons":[]}}],"is_author":false,"is_admin":false},"attachments":[{"origin":{"id":268559,"publication_date":"2024-11-08"},"id":1502545,"name":"Zapytanie ofertowe VCT/5/2024","file":{"id":1674334,"name":"VCT_CKD_05_2024_ZapytanieOfertowe_Bioinfo_08112024.pdf","created_at":"2024-11-08 14:35:40","created_by":{"forename":"Konrad","surname":"Szczukiewicz"},"uri":"/api/files/1674334"},"group_uuid":"5485355b-bfec-48cb-b301-305ee9fefd98"},{"origin":{"id":268559,"publication_date":"2024-11-08"},"id":1502546,"name":"Formularz ofertowy VCT/CKD/5/2024","file":{"id":1674336,"name":"VCT_CKD_05_2024_ZapytanieOfertowe_Bioinfo_Zalcznik1_FO_08112024.pdf","created_at":"2024-11-08 14:36:00","created_by":{"forename":"Konrad","surname":"Szczukiewicz"},"uri":"/api/files/1674336"},"group_uuid":"4a45bea2-33af-4ebb-9ea1-70eabc4fbfad"}]},"dictionaries":{"announcement_status_draft":1,"announcement_status_published":2},"favorite":null,"badge":null,"offer_set_badge_count":null,"question_badge_count":null}}